دوره 16، شماره 6 - ( 6-1395 )                   جلد 16 شماره 6 صفحات 70-63 | برگشت به فهرست نسخه ها

‎ 20.1001.1.10275940.1395.16.6.42.5

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Hassani-Ardekani H, Niroomand Oscuii H. Investigation of the mechanism of dissociation of P-selectin/PSGL-1 complex under stretching with molecular dynamics method. Modares Mechanical Engineering 2016; 16 (6) :63-70
URL: http://mme.modares.ac.ir/article-15-12104-fa.html
حسنی اردکانی هاجر، نیرومند اسکویی هانیه. مطالعه مکانیزم مولکولی جدایش پیوند پی سلکتین/PSGL-1 تحت کشش با استفاده از روش دینامیک مولکولی. مهندسی مکانیک مدرس. 1395; 16 (6) :63-70

URL: http://mme.modares.ac.ir/article-15-12104-fa.html

مطالعه مکانیزم مولکولی جدایش پیوند پی سلکتین/PSGL-1 تحت کشش با استفاده از روش دینامیک مولکولی
هاجر حسنی اردکانی1 ، هانیه نیرومند اسکویی* 2
1- دانشگاه صنعتی سهند
2- دانشگاه صنعتی سهند تبریز
چکیده:   (5499 مشاهده)
روش دینامیک مولکولی یک روش شبیه سازی کامپیوتری است که با حل معادلات حرکت کلاسیک به مطالعه حرکت فیزیکی اتم ها و مولکول ها در یک سیستم N ذره ای می پردازد. در این تحقیق از روش مذکور جهت بررسی تغییر ساختاری یکی از پیوندهای حیاتی در بدن استفاده شده است. این پیوند مابین گیرنده های موجود بر سطح سلولهای دیواره عروقی (اندوتلیال) به نام پی سلکتین و لیگاند های متناظر آنها (PSGL-1) که بر سطح لکوسیت (سلول سفید خون) توزیع گشته اند، ایجاد می شود. یکی از فاکتورهای واسط در فرایند مهاجرت لکوسیت ها به سمت بافت عفونی، که با غلتش این سلول ها روی سلول های اندوتلیال آغاز می شود، تشکیل و شکست متوالی این پیوند می باشد. شناخت مکانیزم جدایش این پیوند در بستر مولکولی در دریافت پاسخ های درمانی اهمیت دارد. بدین منظور جدایش این پیوند تحت کشش به روش دینامیک مولکولی و با استفاده از کد نمد شبیه سازی و نتایج خروجی با استفاده از نرم افزار گرافیکی وی ام دی تحلیل شد. نتایج حاکی از این است که یون کلسیم اهمیت بالایی در بقای پیوند دارد. همچنین با مطالعه مکانیزم شکست باقیمانده های مرزی، مشاهده می شود که پیوند های هیدروژنی ما بین یون کلسیم و باقیمانده فوکوز از گروه قندی و همچنین پیوند های بین باقیمانده های تایروسین سولفاته شده و باقیمانده های مجاور آنها، دارای بیشترین میزان انرژی ناپیوندی هستند. به همین علت با تأخیر نسبت به بقیه پیوندها می شکنند که نشان از اهمیت این باقیمانده ها در پیوند مذکور دارد.
واژه‌های کلیدی: دینامیک مولکولی، نمد، لکوسیت، جدایش پیوند پی سلکتین/PSGL-1، انرژی ناپیوندی
متن کامل [PDF 853 kb]   (5714 دریافت)    
نوع مقاله: مقاله پژوهشی کامل | موضوع مقاله: بیو مکانیک
دریافت: 1394/12/8 | پذیرش: 1395/2/14 | انتشار: 1395/3/22
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.