Modares Mechanical Engineering
مهندسی مکانیک مدرس
Modares Mechanical Engineering
Engineering & Technology
http://mme.modares.ac.ir
1
admin
1027-5940
2476-6909
10.22034/mme
fa
jalali
1393
12
1
gregorian
2015
3
1
15
1
online
1
fulltext
fa
بررسی مکانیسم مولکولی جلوگیری از تشکیل توده های بتا-آمیلوئید توسط پنتا پپتاید به روش شبیهسازی داکینگ و دینامیک مولکولی
Study of inhibition of Aβ42 aggregation and oligomer forming with Docking and MD simulation
آلزایمر شایعترین نوع بیماری زوال عقل در افراد بالای 65 سال میباشد که علت اصلی و روش درمان قطعی آن تاکنون بهدرستی مشخص نشده است. مطالعات آسیبشناختی، تشکیل پلاکهای فیبری و تودههای تجمع یافته پروتئین آمیلوئید بتا در سیستم اعصاب مرکزی را بهعنوان یکی از دلایل بیماری آلزایمر پیشنهاد و مهار این فرایند را بهعنوان روش درمان مؤثر برای این نوع بیماری معرفی کردهاند. ناحیه والین10-اسیدگلوتامیک22 از پروتئین آمیلوئید بتا، در فرایند تجمع منومرها، تشکیل تودههای محلول و پلاکهای فیبری نامحلول نقش اساسی را ایفا میکند. ازاینجهت، مهار این ناحیه میتواند فرایند آمیلوئید شدن را متوقف و از پیشرفت آن جلوگیری کند. گزینهی دارویی استفاده شده در این پژوهش، پنتا -پپتاید جداشده از پایانهی کربوکسیلِ پروتئین آمیلوئید بتا با توالی گلیسین33-گلیسین37 میباشد و نحوه اتصال آن به ناحیه والین10-اسیدگلوتامیک22 از پروتئین آمیلوئید بتا42 به روش شبیهسازی ترکیبی داکینگ و دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفته است. درنتیجه این شبیهسازی، سه محل پیوند پایدار برای اثر پنتا-پپتاید بر گیرنده مشخص شد و تحلیلهای ساختاری بر روی این محلهای پیوند نشان دادند که پنتا-پپتاید استفاده شده با مهار ناحیهی والین10-اسیدگلوتامیک22، میتواند از تجمع و تشکیل تودههای پروتئینی آمیلوئید بتا42 جلوگیری کند. پژوهش حاضر توالی پپتیدی گلیسین33-گلیسین37 را بهعنوان داروی مؤثر در درمان بیماری آلزایمر به دیگر مطالعات پیش کلینیکی در این زمینه، معرفی میکند.
Alzheimer’s disease (AD) is the most common type of dementia in the elderly. The neuropathology and treatment of AD is not precisely determined yet, but according to the pathological studies, AD is associated with presence of toxic soluble oligomers and insoluble senile plaques formed by amyloidosis of Amyloid Beta (Aβ) in neocortical region of brain. The V10HHQKLVFFAE22 is a critical region of Aβ42 which facilitates aggregation process. An attractive therapeutic approach to treat AD is to identify small ligands that are capable of binding to critical residues in order to inhibit or reverse Aβ amyloidosis process as source of neurotoxicity. In this area, therapeutic efforts designed various organic agents and most of them focused on the N-terminal sequence of Aβ. Here, a peptide inhibitor derived from the C-terminal of Aβ (G33LMVG37) is utilized as inhibitor and combined Docking and Molecular dynamics simulation used to find the binding sights in the critical region (V10HHQKLVFFAE22). The simulation identified tree stable binding sites for Aβ42 inhibition by penta peptide. This result indicate that this penta-peptide is capable to inhibit aggregation process and can be consider as an drug for AD preclinical studies.
بیماری آلزایمر,آمیلوئید بتا,شبیه سازی داکینگ,دینامیک مولکولی
Alzheimer’s disease (AD),Amyloid Beta (Aβ),Docking,Molecular dynamics(MD) simulation
39
48
http://mme.modares.ac.ir/browse.php?a_code=A-15-13618-51&slc_lang=fa&sid=15
vahid
khandan
وحید
خندان
100319475328460054152
100319475328460054152
No
graduted student/sharif university of technology
دانشجو تحصیلات تکمیلی/دانشگاه صنعتی شریف
bahar
firoozabadi
بهار
فیروزآبادی دهقان
100319475328460054151
100319475328460054151
Yes
faculty/Department of Mechanical Engineering, Sharif University of Technology
هیئت علمی/دانشکده مکانیک دانشگاه صنعتی شریف
Mohammad Said
Saidi
محمدسعید
سعیدی
100319475328460054037
100319475328460054037
No
Faculty / Department of Mechanical Engineering, Sharif University of Technology
هیئت علمی / دانشکده مکانیک دانشگاه صنعتی شریف